Тогда замок надо смотреть. Поищи - здесь люди и замки по гарантии меняли.
Я не так давно свою проблему решал и писал письмо на АвтоВАЗ по поводу алгоритма работы электропакета. Так вот мне пришел ответ, что ручная разблокировка не может влиять на дальнейшую возможность управлять этим замком через электропакет. То, что ты описываешь может возникнуть на исправной машине только в том случае, если она обесточена (отключен аккумулятор), о чем очень туманно повествуется в инструкции по эксплуатации.