Vovanoto, найди схему и погляди подумай, прикинь что на что может влиять и как, при каком положении. Ты же сам говоришь, что есть определённые положения при которых нет гула, значит или что то поджимается или на оборот (и скорее всего именно на оборот).
Сам же понимаешь если правильно разобрали и правильно собрали и загудело то дело в железе, если же точно известно что железо правильное, то значит собрано не верно.
А от чего могло корпус повести? Был сильный удар или ещё какая-то деформирующая нагрузка. Если от температуры, то думаю в этом случае из кпп должен был бы дым валить. (Сжог без масла)