Если есть желания докопаться и есть оборудование, которое позволяет считать прошивку, то считывает прошивку с ЭБУ и побайтно сравнивает со стоковой (при наличии таковой). Опять же, посмотрим, сколько факторов нужно, что бы слететь с гарантии:
1) сервисмен заподозрил, что у вас не стоковая прошивка
2) есть желание возится с прошивкой, что бы вас снять с гарантии
3) есть необходимое оборудование
4) есть стоковая прошивка
5) есть комп, где можно сравнить прошивки