Это понятно что реле "обеспечивает полную развязку силовой и управляющей цепей" только вот как объяснить такой факт, что когда отсоединили ДТОЖ, на вентиляторе не было напряжения? хотя поставили новую релюху, на всякий случай.
Это был ответ на вопрос - может ли повредиться ЭБУ. Не может.
А вентилятор не включается - так вы не говорите результаты проверок по данным вам советам.
Разъем на самом вентиляторе проверен?
Вместо обмотки реле включить маломощную лампочку, и управлять включением реле через диагностику.
Древовидный вид